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科学家推断出六倍体栽培燕麦起源与演化

时间:2024-12-11 12:21:14

棉( Avena sativa L. , 2n = 6x = 42, AACCDD)作为谷物当中最好的营养食品之一,因高含量蛋白质、不饱和及可溶性膳食纤维而广受购买者青睐。7月18日, Nature Genetic s在线发表了题为 Reference genome assemblies reveal the origin and evolution of allohexaploid oa t的研究课题论文。该研究课题发布了果树万倍本体裸棉及其二倍本体和四倍本体远祖的高品质参阅数列(所示1),并探求了万倍本体棉的追溯与亚数列演本土化(所示2)。该研究课题由四川外语学院、长春市白城市农业该研究所、当吉林大学遗传学与发育生物学研究课题所以及西安交通大学等大学和科研院所合作开发顺利完成。

项目组自由选择来自裸棉追溯当中心的宗教性偏远地区品种“三分三”为材料,基于1028 Gb的三代超长数列,并常用650 Gb的二代数据顺利进行测量仪器,组装了10.76 Gb的染色本体级别的高品质棉参阅数列,其当中contig N50(75.27Mb)、LAI(18.34)、BUSCO(99.44%)。为了更高地阐明万倍本体棉的多倍本土化近现代,该研究课题对其最可能的远祖类群A. longiglumis(2n=2x=14,AlAl)和A. insularis(2n=4x=28,CCDD数列)同时顺利进行PCR和组装。与雀麦的非常数列学深入研究课题推断出,棉人和和小麦人和彼此间的分本土化频发在稻人和构成之后,且数列当中不存在大量染色本体重排政治事件。

为了揭示万倍本体果树棉的追溯与进本土化,科研团队自由选择能代表棉原属所有数列亚型和相异倍性水平的类群顺利进行基于全数列重PCR、转录组PCR和叶绿本体数列PCR,揭示了棉原属类群的网状进本土化种系统。现有的ACD数列万倍本体果树棉是以Al/As数列二倍本体远祖为父本、CD数列四倍本体 A. insularis 为母本繁育加倍后构成的。

棉染色本体在结构上突变的研究课题说明了,万倍本土化后的同源反之亦然在果树棉数列在结构上的构成当中发挥了极其重要作用。同源反之亦然主要频发在A和D亚数列彼此间,且构成了类似马赛克的染色本体六角形在结构上,这也是万倍本体棉的A和D亚数列追溯难题不存在争议的极其重要原因。此外,C亚数列远比于A和D亚数列有更多伸长的遗传学物质家人和,更低的浓缩自由选择,更多的转座q,不屈不挠下更少的表达遗传学物质,这说明了万倍本体棉当中不存在亚数列占优势。

棉参阅数列可为遗传学物质取向和了了提供极其重要参阅。研究课题人员在万倍本体棉的三个亚数列当中鉴定了1269个R遗传学物质。此外,研究课题对659份相异来源地的果树棉的顺利进行全数列联系深入研究课题,鉴定到操纵棉皮裸表现型的极为重要候选遗传学物质satnudsfs4d01g00045。

研究课题工作得到国家棉燕麦工业极为重要技术本体系、科研、长春市人力资源开发基金和长春市科技发展计划等的支持。

所示1.万倍本体棉及其红冠种的高品质参阅数列

所示2.棉与其他雀麦主要水稻的进本土化关系

来源:当吉林大学遗传学与发育生物学研究课题所

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